Arvioinnin avulla voidaan varmistaa, että ekosysteemi toimii asetettujen tavoitteiden mukaisesti, tuottaa todellista arvoa mukana oleville toimijoille ja kehittyy hallitusti muuttuvassa toimintaympäristössä. Ilman säännöllistä arviointia dataekosysteemi voi jatkaa toimintaansa teknisesti oikein, mutta ajautua vähitellen eroon alkuperäisistä liiketoiminnallisista tai yhteiskunnallisista tavoitteista.
Dataekosysteemin arviointi kannattaa tehdä monipuolisesti ja useasta näkökulmasta. Pelkkä tekninen mittaaminen, kuten rajapintakutsujen määrä, datavirtojen volyymi tai järjestelmien käytettävyys, ei yksin riitä antamaan kokonaiskuvaa ekosysteemin toimivuudesta. Vaikka tekninen toiminta olisi sujuvaa, ekosysteemi ei välttämättä tuota arvoa, jos dataa ei hyödynnetä päätöksenteossa, yhteistyö ei toimi tai osapuolet eivät koe saavansa toiminnasta hyötyä.
Dataekosysteemi on luonteeltaan sosio-tekninen kokonaisuus, jossa teknologia, ihmiset ja organisaatiot kietoutuvat toisiinsa. Arvioinnissa on siksi huomioitava myös inhimilliset ja organisatoriset tekijät, kuten toimijoiden sitoutuminen, osaaminen ja yhteistyön sujuvuus. On tärkeää tarkastella, ymmärtävätkö osapuolet datan merkityksen, luottavatko ne toisiinsa ja noudatetaanko sovittuja toimintamalleja käytännössä. Luottamus on erityisen keskeinen tekijä dataekosysteemeissä, sillä ilman sitä datan jakaminen ja yhteinen kehittäminen vaikeutuvat merkittävästi.